La diplomatie, le commerce et la politique constituent les fondements des relations interétatiques. Cependant, l'éducation, notamment l'enseignement universitaire, a également maintenu des liens solides dans de nombreux cas. Des étudiants étudient à l'étranger, des chercheurs collaborent à l'échelle internationale et des établissements tissent des partenariats transfrontaliers, ouvrant ainsi la voie à des relations entre États fondées sur l'éducation. L'enseignement supérieur offre une voie prometteuse pour renforcer la coopération bilatérale entre le Pakistan et la France. Cette coopération se mesure mieux à travers des partenariats institutionnels durables, des programmes académiques conjoints et des collaborations en matière de recherche.
L'accord de partenariat Campus France pour les bourses de troisième cycle a été signé en décembre 2011. Est ensuite venu le programme Hubert Curien Péridot, qui vise à promouvoir la collaboration et la coopération scientifiques entre les institutions des deux pays à travers des recherches communes. En février 2023, le Pakistan et la France ont signé la Feuille de route pour la coopération bilatérale, déclarant l'éducation, la science et la technologie comme un domaine d'intérêt mutuel.
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Ces initiatives coïncident avec les performances remarquables du Pakistan dans les programmes européens d'enseignement supérieur. Le Pakistan s'est classé premier mondial en matière de bourses Erasmus Mundus au cours des cinq dernières années. 189 Pakistanais, 146 Indiens et 119 Bangladais ont obtenu ces bourses en 2024. La tendance s'est confirmée en 2025, avec 114 bourses attribuées au Pakistan, 96 à l'Inde et 95 au Bangladesh. En 2026, les meilleurs étudiants issus du Pakistan, du Bangladesh et de l'Inde étaient respectivement au nombre de 98, 80 et 75.
Le marché international de l'enseignement supérieur en Asie du Sud prend de plus en plus d'importance pour la France, mais la mobilité étudiante varie considérablement d'un pays à l'autre. Les étudiants indiens sont de plus en plus présents en France, avec 9 093 inscriptions dans des établissements français d'enseignement supérieur pour 2024-2025, soit 34 % de plus que l'année précédente, selon les données de Campus France. Le nombre d'étudiants en provenance du Pakistan est passé de 1 000 à 1 497.
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